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从NCBI上自动下载超大序列
应用背景Windows系统,安装了perl环境。可以根据您的搜索条件或者提供的GI号,从NCBI上自动下载超大序列。能自动下载超过50000条以上的核酸或蛋白序列。有时候需要根据自己提供的GI号从NCBI上下载需要的基因或蛋白序列,这个小程序可实现自动下载。在windows操作系统下即可轻松完成,直接双击程序,自动运行下载序列。关键技术放在任何文件夹双击运行。相当于在NCBI首页上查询某物种的基因或蛋白序列,然后自动下载保存为fasta格式。根据使用目的修改脚本。使用方法如下:查询核酸序列:NCBI--左上选Nucleotide--右边输入要查询的物种和限制条件,比如番茄tomato mRNA,出来很多序列,在右下方Search details处,可看到查询条件其实是 ("Solanum lycopersicum"[Organism] OR tomato[All Fields]) AND mRNA[All Fields],复制这个查询条件,粘贴到脚本的第12行$query = ""Solanum lycopersicum"[orgn]"的单引号里面覆盖"Solanum lycopersicum"[orgn],脚本14行$url = $base . "esearch.fcgi?db=protein&term=$query&usehistory=y";里面的db=后面的protein改成Nucleotide,32行$efetch_url = $base ."efetch.fcgi?db=protein&WebEnv=$web"里面的protein也改成Nucleotide。修改这三处之后即可查询得到fasta格式序列。如果查询蛋白序列,按上述方法得到查询条件粘到$query后面,把后面的库db改成protein。查询其它库依此类推。
- 2022-12-23 12:35:03下载
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电子琴原理使用与维修。格式pdg,不容易找到的介绍关于电子琴制作基本理论的书-Principles of use and maintenance of the flower. Format pdg, not easy to find on the keyboard introduction to the basic theory of production of the book
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endnote文献管理软件
EndNote 是一个著名的参考文献管理软件,用来创建个人参考文献库,并且可以加入文本、图像、表格和方程式等内容及链接等信息,能够与 Microsoft Word 完美无缝链接,方便地插入所引用文献并按照格式进行编排。
EndNote 有
- 2023-05-26 12:20:22下载
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fingerprint DOC
国外指纹特征点文件说明,适用于不同的算法-fingerprint DOC
- 2022-03-24 09:02:18下载
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中华人民共和国公安部 LED交通诱导可变标志行业标准
中华人民共和国公安部 LED交通诱导可变标志行业标准-People
- 2022-01-25 17:13:25下载
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这是一篇介绍如何在 unix 系统上使用 鼠标编程的文章。
这是一篇介绍如何在 unix 系统上使用 鼠标编程的文章。-This is a briefing on how the unix systems use a mouse programming articles.
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密码学在TCP/IP应用程序
本文详述了密码学在TCP/IP中的应用-cryptography in TCP/IP applications
- 2022-04-14 20:42:42下载
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freebsd开发者手册,
感兴趣的可以看看,
不错呀.
freebsd开发者手册,
感兴趣的可以看看,
不错呀.-freebsd developers handbook interested can look at, yes you.
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RFC 相关的技术文档
RFC 相关的技术文档-RFC related technical documents
- 2022-08-12 21:50:08下载
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大米生产经营系统操作手册
大米生产经营系统操作手册-rice production system operating manual
- 2022-03-31 15:10:06下载
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