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Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图
应用背景
NCBI上很多基因组DNA序列都有结构描述,其中关于内含子结构的描述通常是 CDS join(1..193,290..1284),表示两个外显子,中间一个是内含子位置,有些基因组DNA更复杂,内含子数目可能达到10个以上,看起来眼花缭乱。很多研究者希望把这些结构信息以图形的形式展示,一目了然,容易分析。用这个perl脚本可以方便的绘制图形,只需要把序列下载下来,输入一个命令自动绘图成功!
关键技术
计算机条件:linux系统,我是在ubuntu系统上使用的。网上下载bioperl 安装。安装很简单,bioperl下载后解压到一个盘上,形成一个文件夹。安装Bio::Graphics的方法,在ubuntu的命令行下输入 sudo perl -MCPAN -e"install Bio::Graphics" 即可自动安装。在Ubuntu安装了bioperl,Bio::Graphics后,可以cd到这些perl脚本和文件所在的文件夹下,在linux终端输入命令行, genbankplot.pl NM_172587.gb >1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb 这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。
- 2022-02-10 02:56:54下载
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何斌的Visual C++数字图像处理
-He Bin Visual C Digital Image Processing
- 2022-03-17 14:24:15下载
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功能是图象的检测,模板匹配如果上
命令行编译过程如下
vcvars32
rc bmp.rc
cl detect.c bmp.res user32...
功能是图象的检测,模板匹配如果上
命令行编译过程如下
vcvars32
rc bmp.rc
cl detect.c bmp.res user32.lib gdi32.lib
这里是vc可直接运行
注意事项:
运行时,文件c: est.bmp必须存在-Function of image detection, template matching on the command-line compiler, if the process is as follows vcvars32rc bmp.rccl detect.c bmp.res user32.lib gdi32.lib here can be directly run vc Note: run-time, file c: est.bmp must exist
- 2022-09-30 18:50:03下载
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用VC++编写得图像旋转和图像滤镜得代码
希望对你们用帮助-Using VC++ to prepare a image rotation and image filters you may wish to use the code to help
- 2022-01-30 21:27:42下载
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