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从NCBI上自动下载超大序列
应用背景Windows系统，安装了perl环境。可以根据您的搜索条件或者提供的GI号，从NCBI上自动下载超大序列。能自动下载超过50000条以上的核酸或蛋白序列。有时候需要根据自己提供的GI号从NCBI上下载需要的基因或蛋白序列，这个小程序可实现自动下载。在windows操作系统下即可轻松完成，直接双击程序，自动运行下载序列。关键技术放在任何文件夹双击运行。相当于在NCBI首页上查询某物种的基因或蛋白序列，然后自动下载保存为fasta格式。根据使用目的修改脚本。使用方法如下：查询核酸序列：NCBI--左上选Nucleotide--右边输入要查询的物种和限制条件，比如番茄tomato mRNA，出来很多序列，在右下方Search details处，可看到查询条件其实是 ("Solanum lycopersicum"[Organism] OR tomato[All Fields]) AND mRNA[All Fields]，复制这个查询条件，粘贴到脚本的第12行$query = ""Solanum lycopersicum"[orgn]"的单引号里面覆盖"Solanum lycopersicum"[orgn]，脚本14行$url = $base . "esearch.fcgi?db=protein&term=$query&usehistory=y";里面的db=后面的protein改成Nucleotide，32行$efetch_url = $base ."efetch.fcgi?db=protein&WebEnv=$web"里面的protein也改成Nucleotide。修改这三处之后即可查询得到fasta格式序列。如果查询蛋白序列，按上述方法得到查询条件粘到$query后面，把后面的库db改成protein。查询其它库依此类推。
- 2022-12-23 12:35:03下载
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这是一个关于蚂蚁算法在机器人路径寻优应用方面的一个幻灯片，希望对对大家有所帮助。-This is one of the ant algorithm robot path optimization application of a slide, and I hope to be helpful to everyone.
- 2022-06-17 12:05:17下载
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- 2023-08-09 09:40:03下载
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- 2023-04-06 14:55:03下载
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单片机与at24c01实例程序，是C语言程序，调试成功，请多下载-Examples of SCM and at24c01 procedure is C language programming, debugging successfully, please download
- 2022-03-02 12:16:52下载
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WE ARE TIHUI,HE TAJIA YIQIJIAOLIU.
此文是本人十多年来在股市中的操作体会，愿意在此公布和大家一起交流。-WE ARE TIHUI,HE TAJIA YIQIJIAOLIU.
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语音词典，语音开发的朋友也许能够用得着-Dictionary voice, voice of a friend may be able to develop useful
- 2022-03-31 03:52:14下载
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系统中分层空时信号检测技术-System of layered space-time signal detection techniques
- 2022-05-30 20:03:22下载
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具备表头拖拽、交换列、排序、添加 、修改、删除、选择等等功能的。NET GRID- Has table to tow entrains, exchange row, arrangement, increase,
revision, deletion, choice and so on function. NET GRID
- 2023-02-28 19:45:03下载
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如题
如题 -if that if that if that
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