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Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图
应用背景
NCBI上很多基因组DNA序列都有结构描述,其中关于内含子结构的描述通常是 CDS join(1..193,290..1284),表示两个外显子,中间一个是内含子位置,有些基因组DNA更复杂,内含子数目可能达到10个以上,看起来眼花缭乱。很多研究者希望把这些结构信息以图形的形式展示,一目了然,容易分析。用这个perl脚本可以方便的绘制图形,只需要把序列下载下来,输入一个命令自动绘图成功!
关键技术
计算机条件:linux系统,我是在ubuntu系统上使用的。网上下载bioperl 安装。安装很简单,bioperl下载后解压到一个盘上,形成一个文件夹。安装Bio::Graphics的方法,在ubuntu的命令行下输入 sudo perl -MCPAN -e"install Bio::Graphics" 即可自动安装。在Ubuntu安装了bioperl,Bio::Graphics后,可以cd到这些perl脚本和文件所在的文件夹下,在linux终端输入命令行, genbankplot.pl NM_172587.gb >1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb 这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。
- 2022-02-10 02:56:54下载
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直方图灰度均衡的代码
直方图灰度均衡的代码-histogram of the gray balance code
- 2022-02-05 23:29:36下载
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GIF format decoder source code. Applicable to ARM platform.
GIF格式文件解码源代码。适用于ARM平台。-GIF format decoder source code. Applicable to ARM platform.
- 2023-03-03 03:35:04下载
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此程序段是采用局部模值最大法来进行边缘检测-edge defect
- 2022-01-25 14:14:23下载
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UI实现图片滤镜的效果
资源描述可以给图片添加滤镜效果,美化图片,使你的图片更加有看点,更加突出,分享一下,大家可以相互学习,适合学习,还有改进的余地,欢迎指正,修改
- 2023-02-22 16:25:05下载
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长方形的填充和背景填充
长方形的填充和背景填充-rectangular background filled and filled
- 2022-01-25 23:11:01下载
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jpeg2000中的空间变换中的DWT,9/7有损小波逆变换,这是在ADI blackfin535 DSP平台下的-JPEG2000 transform space of the DWT, 9/7 inverse wavelet transform detrimental, which is in the ADI blackfin535 DSP platform
- 2022-09-10 20:50:03下载
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用VC++实现的数字识别系统,功能齐全,可直接使用。-with VC++ to achieve the number recognition system, complete functions, and can be used directly.
- 2023-08-26 12:35:03下载
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histogram that the importation of image histogram function of the amendment
直方图修正对输入图象进行直方图的修正功能-histogram that the importation of image histogram function of the amendment
- 2022-03-09 16:02:30下载
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选取两幅图像的对应点后计算出变形函数,图像变形后再将两幅图像镶嵌为同一副图像-Select the two images correspond to point out the deformation function, image deformation and then to two images for the same Vice-image mosaic
- 2022-02-07 06:29:38下载
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